2020

Ngày 17 tháng 2 năm 2020, Ban trị sự Giáo hội Phật giáo Việt Nam đã gửi công văn đến Hội đồng trị sự Trung ương[lower-alpha 1] xử lý về những việc làm sai trái của tịnh thất Bồng Lai.[51] Đến ngày 24 tháng 2 năm 2020, Sở Nội vụ tỉnh Long An đã kết luận Tịnh thất Bồng Lai chỉ là hộ gia đình, không phải là cơ sở tôn giáo.[51]

Ngày 21 tháng 5 năm 2020, Ủy ban nhân dân huyện Đức Hòa đã kiểm tra hành chính tại tịnh thất Bồng Lai.[25] Theo kết quả điều tra vào ngày 21 tháng 5 năm 2020, Tịnh thất Bồng Lai không phải là chùa hay tịnh thất vì không có giấy phép hoạt động.[25][52] Ngoài ra, tịnh thất Bồng Lai không thuộc sự quản lý của Giáo hội Phật giáo Việt Nam tỉnh Long An, khẳng định rằng các chú tiểu, tăng ni không phải là tu sĩ Phật giáo.[25][52]

Ngày 22 tháng 9 năm 2020, Công an tỉnh Long An phối hợp với Đài truyền hình tỉnh Long An đã cho phát phóng sự về tịnh thất Bồng Lai với tên Sự thật về nơi tự xưng Tịnh thất Bồng Lai.[53] Theo như kết quả điều tra ngày 22 tháng 9 năm 2020, tịnh thất Bồng Lai hiện có 18 người sinh sống, trong đó có 6 chú tiểu đã dự thi Thách thức Danh hài đều có mẹ ruột cùng tạm trú, cha không xác định. Cũng theo kết quả điều tra, tịnh thất Bồng Lai được cơ quan chức năng kết luận rằng tịnh thất Bồng Lai lợi dụng danh nghĩa nuôi trẻ mồ côi, cơ nhỡ, kêu gọi các nhà hảo tâm và người dân trong và ngoài nước để trục lợi cá nhân.[53]

2021

Đầu tháng 10 năm 2021, có một người tên Lê Thanh Minh Tùng tự xưng là con trai ruột của ông Lê Tùng Vân, chủ tịnh thất Bồng Lai.[33] Anh đã tố cáo cha ruột của mình và một số người liên quan tại tịnh thất Bồng Lai.[33][13] Theo đó, Lê Thanh Minh Tùng nói trên video của Nguyễn Phương Hằng rằng anh là con của ông Lê Tùng Vân và em của ông.[54]

Ngày 5 tháng 11 năm 2021, tại Họp báo Bộ Nội vụ, ông Nguyễn Tiến Trọng đã khẳng định Tịnh thất Bồng Lai có dấu hiệu lợi dụng tôn giáo để trục lợi.[33][34][35][36]

Trung ương Giáo hội Phật giáo Việt Nam đã khẳng định Tịnh thất Bồng Lai không phải là cơ sở tự viện hợp pháp do Ban trị sự giáo hội tỉnh Long An quản lý. Giáo hội Phật giáo Việt Nam đã gửi yêu cầu đến Ủy ban nhân dân tỉnh Long An xử lý vi phạm.[55]

Ủy ban nhân dân tỉnh Long An gửi cho Ban Tôn giáo chính phủ, bao gồm việc tịnh thất Bồng Lai do cá nhân đứng tên giấy chứng nhận quyền sử dụng đất, sử dụng đất trồng lúa vào mục đích khác không được cơ quan huyện cho phép. Ủy ban nhân dân xã đã lập biên bản xử phạt hành chính với bà Cao Thị Cúc và yêu cầu trả lại hiện trạng đất như cũ.[33][34][35][36][55] Ngoài ra, tại tịnh thất Bồng Lai đã có 6 trẻ em[lower-alpha 2] sống cùng với mẹ ruột, và hai trẻ nhận nuôi vào năm 2019, tuy nhiên Ủy ban xã chưa thống nhất để tịnh thất Bồng Lai nhận con nuôi.[33][34][35][36][55]

Ngày 7 tháng 11 năm 2021, Sở Nội vụ tỉnh Long An đã thành lập đoàn kiểm tra tại Tịnh thất Bồng Lai.[56] Gần đây, 1 bé được cậu ruột đưa về Huế sinh sống, và 1 bé được bà Cao Thị Cúc hoàn tất pháp lý.[56] Một số người đã gửi đơn tố cáo ông Lê Tùng Vân do có hành vi dụ dỗ phụ nữ và cơ quan chức năng tỉnh Long An đang tiếp nhận.[56]